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Compartimentazione di membrane cellulari tramite separazione di fase controllata dalla diffusione
Parole chiave FISICA STATISTICA, MEMBRANE, SEPARAZIONE DI FASE
Riferimenti ANDREA ANTONIO GAMBA
Gruppi di ricerca AA - Statistical Physics and Interdisciplinary Applications
Tipo tesi TESI MAGISTRALE
Descrizione L'accoppiamento di circuiti biochimici di retroazione positiva alla diffusione fornisce un meccanismo generale per la generazione di domini arricchiti in specifici fattori molecolari sulle membrane cellulari. Questi domini giocano un ruolo fondamentale nella fisiologia della cellula, essendo coinvolti per esempio nella migrazione, nella generazione di strutture multicellulari funzionali, e nella distillazione di specifici fattori molecolari [1-4]. The thesis will focus on the characterization of the hydrodynamic behavior of these domains, and on the coarse-grained description of their generation and growth as a phase-separation process.
[1] E. Floris et al, Physics of compartmentalization: How phase separation and signaling shape membrane and organelle identity, Computational and Structural Biotechnology Journal 19, 3225–3233, 2021
[2] J. Kirschbaum and D. Zwicker, Controlling biomolecular condensates via chemical reactions, Journal of the Royal Society Interface 18, 20210255, 2021
[3] A. Gamba et al., Diffusion-limited phase separation in eukaryotic chemotaxis, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102, 16927, 2005
[4] M. Zamparo et al, Optimality in self-organized molecular sorting, Physical Review Letters 126, 088101, 2021
Conoscenze richieste Buona preparazione in fisica statistica e computazionale. Buona conoscenza del linguaggio Julia.
Scadenza validita proposta 30/03/2024
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